GA黄金甲

北京基因组所(国度生物信息中心)猴痘病毒基因组信息库MPoxVR获得进展

  1970年在刚果民主共和国发现首例猴痘病毒习染者以来 ,猴痘疫情先后屡次在中西非国度暴发。自2022年5月至今 ,多个非盛行区国度出现猴痘疫情。7月23日 ,世界卫生组织(WHO)报路已有75个国度和地域汇报16,000余个病例 ,并将其颁发为国际关注的公共卫生垂危事务(PHEIC)。为支持猴痘病毒有关钻研 ,援手国内表预防和应对猴痘疫情的暴发 ,GA黄金甲(国度生物信息中心)组建猴痘钻研工作组 ,于6月10日颁布猴痘病毒资源库MPoxVR。

  8月1日 ,北京基因组所宋述慧钻研员和鲍一明钻研员受邀在国际学术期刊The Innovation 在线颁发题为“MPoxVR – A comprehensive genomic resource for monkeypox virus variants surveillance”的评论文章 ,系统比力并介绍了猴痘病毒信息库MPoxVR的数据资源及特色职能。

  MPoxVR收录整合了迄今为止来自GenBank的777条猴痘病毒和12,065条其它痘病毒科的基因组序列及其对应元信息 ,并通过人为审编补充了部门序列中缺失的元信息 ,如宿主、采样日期和采样地址等 ,为钻研人员发展基于序列的比力、传布演化分析等提供了基础数据资源。

  MPoxVR还提供了丰硕的基因组变异和职能注解信息 ,变异数据提醒 ,采样自2022年5月疫情暴发以来的序列突变较少 ,大部门序列的SNP变异数量领域为0-11个 ,沉要职能基因如免疫逃逸、宿主领域、细胞增殖、抗病毒药靶等的突变产生率较低 ,核酸检测的引物结合区尚未产生新的变异。猴痘病毒的变异信息可为其传布链追踪、溯源、疫情防控和疾病医治等提供沉要的数据信息与决策支持。此表 ,MPoxVR还开发了四个沉要的在线分析工具 ,蕴含基因组注解、基因组变异鉴定、变异职能注解和序列类似性比对BLAST。

  与国际上其它痘病毒有关数据库相比 ,MPoxVR是猴痘病毒基因组及序列信息和分析工具的综合专业库 ,将推进猴痘病毒起源、传布方式等有关钻研 ,服务于疫情防控。

  该工作得到了GA黄金甲青年推进会项主张支持。

GA黄金甲·体育(中国)官方网站

?  MPoxVR数据库序列地理散布和变异数散布?

  论文链接?

附件下载:
【网站地图】