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国度生物信息中心合作构建免疫衰老多组学数据库

随着全球人丁老龄化趋向的加剧 ,老年人丁的健全问题日益受到关注。在这一布景下 ,免疫衰老(Immunosenescence)作为影响老年人健全的关键成分之一 ,逐步成为钻研的焦点。免疫衰总是指随着春秋增长 ,免疫系统职能逐步减退的景象 ,蕴含新免疫细胞的天生削减、现有免疫细胞的职能扭转以及慢性低度炎症状态的持续存在 ,通常被称为“炎症老化”。免疫衰老与习染性疾病的易感性增长和慢性春秋有关疾病的发病风险上升亲昵有关。

为了深刻理解这一复杂过程并寻找延缓衰老的战术 ,11月30日 ,国度生物信息中心张维绮团队、鲍一明团队和GA黄金甲动物钻研所刘光慧钻研组、曲静钻研组合作 ,成立了免疫衰老领域首个多组学数据库Immunosenescence Inventory ,旨在为整合和分析与免疫衰老有关数据提供一体化平台。该钻研以“Immunosenescence Inventory—a multi-omics database for immune aging research”为题在Nucleic Acids Research?期刊颁发。

该数据库网络和整合了来自人类和其他动物物种的免疫衰老有关数据集 ,覆盖了宽泛的免疫衰老的细胞特点、分子标志物以及随春秋纵向变动的多组学信息 ,蕴含单细胞转录组学、转录组学、表观基因组学以及T细胞受体和B细胞受体的免疫组库数据(图1) ,为理解免疫衰老的细胞分子变动提供了沉要数据资源。

该数据库由知识图谱、多组学数据集和工具三大主题?樽槌。知识图谱?楣菇艘桓鍪种锻计 ,具体纪录了免疫细胞类型、分子标志物、与免疫有关的基因注解、免疫细胞随春秋动态变动的特点、与衰老有关的细胞因子变动以及免疫衰老的生物标志物和过问战术。多模态数据集?檎故玖朔制缥镏置庖咚ダ系亩辔檠П涠。其中 ,单细胞转录组学?橥缌死醋4个物种、13种组织中59种免疫细胞的基因表白变动(图2)。工具?樵蛱峁┝嗽谙吖ぞ ,以辅助发展免疫细胞鉴别和免疫时钟推算。

综上 ,Immunosenescence Inventory对免疫衰老知识与数据进行了专业的整合 ,并将持续更新和盛开 ,为将来免疫衰老机造钻研和新型过问战术开发提供有力支持。

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单细胞转录组学?

国度生物信息中心张维绮钻研员、鲍一明钻研员、GA黄金甲动物钻研所刘光慧钻研员、曲静钻研员为本文的共同通讯作者。国度生物信息中心李豪博士、赵薇博士、杨飞工程师、乔琴助理钻研员、GA黄金甲动物钻研所/北京干细胞与再生医学钻研院马帅“致一”钻研员、国度生物信息中心硕士毕业生杨宽、宋述慧钻研员为本文的共同第一作者。首都医科大学宣武医院王思钻研员为本文提供了领导。该钻研获得国度天然科学基金委、国度科技部、GA黄金甲和北京市等项主张赞助。

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