国度生物信息中心颁布基因序列数据库GenBase
基因的序列和注解信息（蕴含DNA、RNA和蛋白序列信息）是支持基因职能钻研的主题基础数据之一。伴随生物学的迅猛发展 ，在从前几十年中 ，我国性命科学领域产出了海量的基因序列数据。为满足我国科研人员在基因序列数据汇交、治理和共享过程中的现实需要 ，急需开发相应的基因序列数据库。
近日 ，国度生物信息中心颁布基因序列数据库GenBase ，并以“GenBase: A Nucleotide Sequence Database”为题在学术期刊Genomics Proteomics Bioinformatics?在线颁发。
GenBase对标美国国度生物信息中心NCBI的GenBank数据库 ，是一个存储、治理、共享所有物种基因序劣注注解信息及其编码蛋白质序列的公共资源库 ，可为基因序列数据的汇交、存储、颁布和共享提供一系列Web服务 ；贕enBase的提交系统 ，用户可凭据具体的操作提醒 ，按步骤提交蕴含提交者信息、参考文件、核苷酸序劣注数据起源、数据特点等在内的沉要的实体和元数据信息。GenBase严格把控数据质量 ，保险基因序列数据的正确性、齐全性和可用性。GenBase系统遵循国际核酸序列共享同盟（International Nucleotide Sequence Database Collaboration ，INSDC）的有关尺度 ，安身中国 ，服务全球 ，可接管来自全球科研人员的数据提交。截止到2024年8月1日 ，GenBase共接管了来自197个单元、309个用户、2,650个批次的81,929条核酸序列及832,740条蛋白序列。其中 ，76,340 条核酸序列(93%) 与723,863 注解的蛋白序列(87%) 已开释 ，支持了51篇论文的颁发。出格地 ，GenBase接管了63,006条新冠病毒序列 ，其中的 59,913条已开释。同时 ，为保险全球基因序列数据的本地化治理 ，GenBase还整合了INSDC颁布的约5.8亿条核酸和蛋白序列 ，提高国内科研人员查问和获取数据的效能。
国度生物信息中心卜琮凡、郑欣畅、赵学彤、徐添翼、白雪为该文共同第一作者 ，唐碧霞高级工程师和鲍一明钻研员为该文共同通讯作者。本工作得到了GA黄金甲战术性先导专项、国度沉点研发打算、“一带一路”国际科学组织同盟国际专题网络、GA黄金甲国际合作项目“国际基因组学数据共享系统研发”和国际生物多样性与健全大数据共享打算的项目支持。
论文链接
GenBase整体架构
