GA黄金甲

DNA甲基化是最早发现的表观遗传象征之一，其在真核细胞基因表白调控中起着至关沉要的作用。随着DNA甲基化检测技术的不休进取，钻研人员发现DNA甲基化拥有齐全甲基化和半甲基化两种状态，并发现了能够不变遗传的半甲基化建饰，但目前对于DNA半甲基化是否拥有怪异的生物学职能这一问题仍有争议，因而仍需对DNA半甲基化进行系统的钻研。此表，传统的基于碱基化学转化的甲基化测定技术会对DNA造成较大危险，因而开发一种更为和善高效的半甲基化测定步骤很有必要。

GA黄金甲（国度生物信息中心）徐晨欢团队通过利用特异性鉴别DNA单链甲基化的限度性内切酶MspJI，开发了一种不依赖于碱基转化的半甲基化测定技术，Mhemi-seq (MspJI-assisted hemi-methylation sequencing)。相较于传统DNA甲基化测定技术，Mhemi-seq重要拥有两个利益。一是Mhemi-seq不依赖于碱基转化，预防了对DNA造成危险，因而能够更高效的对微量DNA中CpG的甲基化状态进行鉴定。另一优势是其能够通过对MspJI酶切位点的分析直接实现对单CpG上半甲基化状态的鉴定。

钻研团队将Mhemi-seq利用于淋巴母细胞系GM12878及两种人源胚胎干细胞H1和H9，并成立了这三种细胞的甲基化和半甲基化图谱。Mhemi-seq天生的甲基化图谱与碱基化学转化步骤得到的甲基化图谱根基一致，证明其能够正确的捉拿到单CpG分辨率的DNA甲基化状态。通过对Mhemi-seq的了局进行分析，钻研团队发现半甲基化CpG能够抑造转录因子CTCF的结合和PCGF1调控的基因表白，并且其抑造程杜纂齐全甲基化较为类似，暗示半甲基化可能足够实现通常DNA甲基化对基因表白的调控作用。此表，利用Mhemi-seq，钻研团队还在回转座子Alu原件上发现了一类和Alu?表白有关的特殊DNA半甲基化。

综上所述，Mhemi-seq能够精准高效的鉴定基因组中CpG的甲基化和半甲基化状态，为DNA甲基化钻研领域提供了一种新的便捷工具。

该成就以“Uncovering the roles of DNA hemi-methylation in transcriptional regulation using MspJI-assisted hemi-methylation sequencing”为题，于1月24日颁发于Nucleic Acids Research?期刊。GA黄金甲（国度生物信息中心）徐晨欢钻研员为本文的通讯作者，GA黄金甲（国度生物信息中心）硕士钻研生熊雄和出格钻研助理（博士后）陈亨野为本文的共同第一作者。该钻研得到了国度天然科学基金、国度沉点研发打算等项主张赞助。

Mhemi-seq尝试道理（上）及半甲基化在CTCF结合和PCGF1调控的基因表白中的作用（下）

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