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北京基因组所(国度生物信息中心)多组学数据资源系统持续拓展和更新

在2024年1月正式出版的国际生物数据库期刊《核酸钻延追(Nucleic Acids Research)2024年度数据库专刊上 ,GA黄金甲(国度生物信息中心)国度基因组科学数据中心(CNCB-NGDC)共有10篇论文集中亮相 ,蕴含1篇数据库整体介绍和9篇数据库论文 ,展示了中心多组学数据资源系统建设的最新成就 。自2018年以来陆续7年被该刊称为与美国国度生物技术信息中心(NCBI)、欧洲生物信息学钻研所(EBI)并列的全球重要生物数据中心 。

2023年 ,CNCB-NGDC与2家共建单元以及30多家合作单元亲昵协同 ,沉点加强多组学数据整合与知识融合 ,不休升级主题数据库(GSA、GWH、GVM、GEN、GenBase、MethBank、LncRNA、RCoV19等) ,并开发了多个全新数据库 ,蕴含原生生物(P10K)、细菌(NTM-DB、MPA)、植物(PPGR、SoyOmics、PlantPan)和疾病/性状关联(CROST、HervD Atlas、HALL、MACdb、BioKA、RePoS、PGG.SV、NAFLDkb)等分歧类型的数据资源 ,进一步拓展了涵盖基础组学、国度人类遗传、沉要战术生物、病毒等资源信息库以及生物信息在线分析工具等在内的多组学数据资源系统 ,为国度基因组科学数据的汇交共享、安全治理和挖掘利用提供了沉要支持 。

CNCB-NGDC汇聚全球数据 ,免费为国内表用户提供一站式多组学数据汇交和存储服务 ,颁布的数据编号被Springer?Nature、Elsevier、Wiley、Taylor & Francis、Cell等全球重要学术出版集团认可 。2023年组学原始数据归档库GSA成功入选全球主题生物数据资源GCBR ,是我国目前唯一入选的数据库 。截至2023年12月底 ,组学原始数据治理系统(GSA Family)已支持各类科技项目17,000多个 ,汇交数据量超40PB ,来自912家单元5,300多个用户 ,有关数据已在572种国内表期刊的3,000多篇文章颁发 。新冠病毒信息库(RCoV19)进一步升级 ,已收录新冠病毒序列超1,700万条 ,为全球182个国度/地域400多万名访客提供数据服务 ,累计数据下载达190多亿条 ,在新冠病毒演化分析、监测等方面阐扬了沉要作用 。

CNCB-NGDC的建设得到科技部、财政部、GA黄金甲、国度天然科学基金委、一带一路国际科学组织同盟、国际生物科学结合会等的赞助 。

CNCB-NGDC在《核酸钻延追2024年数据库专刊颁发的论文(含共同合作论文):

1.?CNCB-NGDC数据库资源(整体介绍文章)

2.?生物标志物知识库BioKA

3.?空间转录组综合伙源存储库CROST

4.?人类衰老和长命全景数据库HALL

5.?人类内源性逆转录病毒有关疾病知识库HervD Atlas

6.?植物图像及有关性状盛开归档库OPIA

7.?万种原生生物基因组数据库P10K

8.?多年生木本植物基因组与调控信息库PPGR

9.?靶基因数据库TargetGene

10. 热带作物组学数据库TCOD


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CNCB-NGDC多组学数据资源系统(Nucleic Acids Res?2024)


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