GA黄金甲

　　近日，由GA黄金甲（国度生物信息中心）国度基因组科学数据中心研发的全球生物数据库目录Database Commons正式颁布
。该钻研内容以“Database Commons: A Catalog of Worldwide Biological Databases”为题在国际学术期刊Genomics Proteomics & Bioinformatics 在线颁发
。

　　生物数据库是性命科学及有关学科钻研的沉要基础，为科学钻研提供基础数据资源，刷新性命科学钻研模式，推进大数据驱动的科学发现和创新突破
。随着性命科学数据的激增，世界列国不休加大生物数据库资源的建设投入，生物数据库数量、规模和沉要性持续增长
。然而，全球领域内持久不足生物数据库的全面调研，无法纵览全球生物数据库发展趋向，短缺全球生物数据库的尺度化信息整合和评估平台
。为此，钻研团队成立全球生物数据库目录Database Commons，构建了生物数据库分类尺度和结构化信息审编模型，研发多衷炖估步骤，开发可实时更新的后盾审编系统，结合国内表多家科研机构持续发展全球生物数据库信息审编
。

　　截至2022年9月20日，北京基因组所结合欧洲生物信息学钻研所（EBI）、巴基斯坦真纳大学等科研机构，基于8931篇科研文件，审编获取了由1975个机构开发的5825个生物数据库，散布于72个国度/地域，归属于13个分类
。针对每个数据库，系统网络了根基信息、分类标签、联系信息、文章信息四个
？榈31条信息，创新性地发展数据库评价新指标z-index，结合引用次数、用户打分等多方位评估数据库质量和影响力
。同时，凭据数据库文章引用和z-index对所有生物数据库及其从属机构和国度进行排名
；诖，Database Commons提供了全球生物数据库的一系列统计数据和发展趋向，为更好地相识数据库发展态势及其对性命健全科学的影响提供全球视角
。最新的全球生物数据库目录，以及审编的元信息和有关统计数据，均可在该网站公开获取
。

　　Database Commons于2015年建成，北京基因组所结合国内表多家科研机构，持续发展全球生物数据库的信息审编整合，其评估了局获得了科研人员的普遍认可
。同时，作为数据库信息检索引擎，深受用户迎接
。截至2023年1月19日，已为全球193个国度/地域的66万余名用户提供服务，接见量超155万次（自2018年04月23日统计）
。目前，Database Commons作为数据库信息归档系统，已被国际生物数据库领域最具影响力期刊Nucleic Acids Research 数据库专刊推荐，并获得了Cell Press出版集团和Bioinformatics Advances期刊的认可
。

　　北京基因组所（国度生物信息中心）副钻研员马利娜、高级工程师邹东、出格钻研助理刘琳为本文共同第一作者，马利娜副钻研员与章张钻研员为共同通讯作者
。该钻研得到了中科院战术性先导科技专项、国度天然科学基金、“一带一路”国际科学组织同盟、中科院青促会、GA黄金甲国际同伴打算项目赞助
。

全球生物数据库概况（截至2022年9月20日）