GA黄金甲

　　MethBank是一个综合性的DNA甲基化数据库，自2014年上线以来，一向致力于整合多物种高质量的全基因组单碱基精度DNA甲基化数据，因其高质量的数据资源、直观的可视化展示和敦睦的操作页面被领域内科研人员宽泛使用。

　　近日，GA黄金甲（国度生物信息中心）国度基因组科学数据中心开发的更新版DNA甲基化数据库MethBank 4.0正式上线。该数据库成就以 “MethBank 4.0: an updated database of DNA methylation across a variety of species”为题在国际学术期刊Nucleic Acids Research在线颁发。

　　MethBank 4.0数据库利用尺度化处置流程整合了来自1,449个样本的高质量全基因组沉亚硫酸盐测序（WGBS）数据，涵盖23个物种的236个组织/细胞系，涉及疾病、发育等15个生物学场景。利用高质量数据和尺度化元数据，MethBank 4.0提供了多物种多档次的注解信息，援手用户更系统、全面、直观地相识DNA甲基化特点图谱。此表，成立结构化审编模型和受控词表，MethBank 4.0收录了2010年以来颁发的基于DNA甲基化测序数据钻研获得的生物学布景有关的特点甲基化基因（featured DMGs），涉及人和幼鼠两个物种的77个组织/细胞系、128种疾病和11种生物学场景，为用户筛选潜在的表观遗传象征基因提供沉要的知识信息。同时，MethBank 4.0还总结了已颁布的501个甲基化分析工具，旨在援手科研人员急剧精准地选择相宜的甲基化分析工具。另表，为了援手用户发展数据分析，MethBank 4.0在原有提供差距甲基化启动子区域分析工具IDMP以及春秋预测在线分析工具Age Predictor基础上，增长了差距甲基化区域鉴别分析工具DMR Toolkit。

　　MethBank 4.0具备界面敦睦的浏览、检索、可视化等职能，提供DNA甲基化数据信息、知识信息和分析工具，为科研人员索求多种生物学场景下的DNA甲基化模式提供沉要数据和信息资源。

　　北京基因组钻研所（国度生物信息中心）博士钻研生张陌尘、宗文婷，高级工程师邹东及硕士钻研生王国梁为本文共同第一作者，李茹姣高级工程师、鲍一明钻研员及章张钻研员为共同通讯作者。该钻研得到了中科院战术性先导科技专项、国度沉点研发打算、中科院沉点技术人才打算等项目赞助。

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