GA黄金甲

　　基因组序列变异与表型关联知识，重要是通过全基因组关联分析(GWAS)，在全基因组领域内鉴定与特定疾病或表型性状等有关联的遗传变异位点，是挖掘和揭示生物复杂性状分子遗传机造的沉要资源。

　　近日，GA黄金甲（国度生物信息中心）国度基因组科学数据中心正式颁布更新版动植物基因组变异与表型关联知识库GWAS Atlas v2.0，以“GWAS Atlas: an updated knowledgebase integrating more curated associations in plants and animals”为题在国际学术期刊 Nucleic Acids Research 在线颁发。 

　　GWAS Atlas钻研团队每年持续审编公开颁发的GWAS钻研文章，依照统一的审编模型系统整顿基因组变异与表型的关联知识。GWAS Atlas v2.0基于830篇科研文件，提供了15个物种（蕴含10种植物和5种动物）及与其1444个性状有关联的278109条基因型与表型关联知识。为进一步精密定位与复杂生物性状有关联的候选遗传位点，钻研团队通过对所有关联知识进行连锁不平衡分析，鉴定到与439个性状有关的6084个独立变异位点（Lead SNPs）

；并通过生物审编，新收录157个性状的486个经尝试验证的因果变异（Casual variants）。这些遗传位点的系统分析和整合能够援手我们更好地理解复杂性状的遗传结构，为进一步高效定向育种提供越发精确的数据知识，进而提高种质资源利用率。  

　　为更好服务用户数据的汇交和分析，GWAS Atlas v2.0还成立了GWAS关联知识的在线汇交职能，以方便用户在线批量递交钻研了局，并为每一个递交数据分配唯一可识此外标识符，凭据递交用户设定的数据公开功夫进行可控治理

；同时新研发上线了LeadSNPFinder、GeneFinder、MHPlotter和QQPlotter四个在线分析和画图工具，方便用户发展数据的挖掘利用分析和可视化分析了局。总之，GWAS Atlas 2.0为将来沉要农艺性状的
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