北京基因组所(国度生物信息中心)合作构建再生生物学多组学数据库
随着细胞沉编程、基因编纂、合成生物学、高通量测序等技术的急剧发展,再生生物学进入前所未有的蓬勃发展时期,助力解决组织代替、职能建复、衰老过问、疾病医治等一系列性命医学领域的沉要科学难题。面对科学数据的爆炸式增长,亟需成立以再生生物学为主题的盛开数据库,以存储世界领域内的组学钻研数据为基础,推动再生有关的基础钻研和临床转化利用的不休发展。
9月30日,GA黄金甲(国度生物信息中心)鲍一明钻研组、张维绮钻研组和动物钻研所刘光慧钻研组、曲静钻研组合作在 Nucleic Acids Research 杂志颁发了题为“Regeneration Roadmap: database resources for regenerative biology”的论文,成立了再生生物学领域首个多组学数据库Regeneration Roadmap。该数据库从转录组、单细胞转录组、表观基因组及药物基因组等分歧层面整合了再生有关数据集,涉及11个物种、36种组织类型,实现了分歧前提下基因表白随再生变动的汇聚融合,以及对分歧档次组学数据的交互查问和结合比力分析。此表,数据库收录了基于已有文件报路的再生有关基因集,使得用户能够越发深刻全面地相识特定基因或通路在再生生物学中的职能。
Regeneration Roadmap数据库实现了对多物种再生有关的分歧档次组学数据的收录与整合。作为一个持续更新的国际化信息平台,Regeneration Roadmap 的成立为国内表再生生物学有关数据的统一汇交、集中存储、安全治理、盛开共享以及前沿交叉钻研和临床转化利用提供沉要助力和支持。该数据库对用户免费盛开,有关运维团队将对该数据库进行定期守护与更新,不休整合更多的再生有关数据资源、汇交多档次组学数据。此表,该团队于2020年成立了Aging Atlas数据库,收录和整合了与衰老有关的分歧档次多组学数据。目前Aging Atlas数据库已服务来自全球25个国度的上万名接见者。Aging Atlas和Regeneration Roadmap数据库将形成资源互补,共同推动衰须生物学和再生生物学的学科发展。
Regeneration Roadmap数据库由中科院北京基因组所(国度生物信息中心)、中科院动物所、中科院干细胞与再生医学科学数据中心、中科院干细胞与再生医学创新钻研院、北京干细胞与再生医学钻研院、首都医科大学宣武医院国度老年疾病临床钻研中心等机构合作实现。数据库的建设得到了GA黄金甲周琪院士、GA黄金甲干细胞与再生医学创新钻研院胡宝洋钻研员、GA黄金甲(国度生物信息中心)杨运桂钻研员、任捷钻研员,首都医科大学宣武医院国度老年疾病临床钻研中心王思钻研员、中科院动物所宋默识钻研员的领导和支持。该项目获得国度科技部、国度天然科学基金委、GA黄金甲和北京市等项主张赞助。
论文链接

Regeneration Roadmap数据库






