GA黄金甲

　　新型冠状病毒SARS-CoV-2是造成COVID-19在全球领域肆虐的病因。该病毒为一种单股正链RNA病毒，拥有高传染性个性，可能习染人体各代谢系统的多种组织器官，并引发严沉的临床症状，深刻钻研新冠病毒基因组RNA的个性极度必要。

　　2021年8月2日，GA黄金甲（国度生物信息中心）杨运桂钻研组和中国医学科学院医学生物学钻研所彭幼忠钻研组合作在Protein & Cell杂志上颁发了题为“Comprehensive analysis of RNA-seq and whole genome sequencing data reveals no evidence for SARS-CoV-2 integrating into host genome”的钻研成就。借助RNA测序（RNA-seq）和全基因组测序，钻研团队对SARS-CoV-2习染的人和猴细胞在转录组和基因组水平进行了分析，发现没有直接证据批注新型冠状病毒RNA可能整合进宿主基因组。

　　钻研团队首吓酌SARS-CoV-2别离习染了人类细胞系（293T、Huh-7和Calu-3）和猴细胞系（Cos-7和MA-104），并进行了转录组测序。分析发现，测序了局中存在宿主-病毒嵌合序列，其数量约占病毒测序读段总量的0.5%-1.8%，但这些嵌合事务沉复性极低，并与宿主基因表白水平正有关。之后对人类的三种细胞系进行全基因组测序，钻研团队并未在转录组高频嵌合事务对应的DNA片段上鉴定到嵌合信号，甚至未检测到任何能与SARS-CoV-2参考基因组匹配的DNA读段。以上了局批注，SARS-CoV-2或并不具备整合进宿主基因组的能力，转录组测序数据中的嵌合序列可能来自其它蹊径，如RNA测序文库构建过程中的随机衔接。

　　为验证该如果，钻研团队将SARS-CoV-2习染细胞和未习染斑马鱼胚胎的RNA进行混合，构建RNA测序文库并进行转录组测序及分析。了局批注，除了人-病毒嵌合RNA片段，天然前提下不成能存在的斑马鱼-病毒嵌合RNA片段也呈此刻了转录组测序了局中，并且两物种的各自嵌合读段数与其在混合样本中RNA丰度比例险些一致，证了然嵌合RNA读段来自文库构建过程中的随机衔接的推论。本钻研通过对转录组测序、全基因组测序以及混合样本转录组测序了局的系统性分析，发现并没有直接证据批注SARS-CoV-2可能整合进宿主基因组，其嵌合信号重要来自于建库过程的随机衔接。

　　该钻研得到科技部国度沉点研发打算等基金赞助。

转录组及全基因组测序揭示新型冠状病毒RNA不具备整合进宿主基因组的能力