基因组所“人类基因春秋”钻研获新进展
从单细胞生物到智人约莫4000百万年进化过程中 ，基因不休地获得与迷失 ，使得基因都拥有特定的基因春秋（Gene Age） ，并在漫长的演化过程中留下与基因春秋有关的印记（Age-Related Signatures; ARS） 。因而 ，探求基因春秋与ARS可援手我们深刻揭示分子进化机造、基因职能形成以及人类基因的演化汗青 。近期 ，北京基因组钻研所“院基因组科学与信息沉点尝试室”、“性命与健全大数据中心」芈张钻研员携带的科研团队通过划分基因春秋 ，追忆人类基因演化汗青 ，整合分析多组学档次上的ARS ，发展ARS与基因春秋的系统钻研获得了一系列工作进展 。该项钻研成就近期在Genome Biology and Evolution杂志在线颁发 。
在性命与健全大数据中心（BIG Data Center；http://bigd.big.ac.cn）高机能推算平台的有力支持下 ，钻研团队首先在钻研技术层面 ，基于马尔可夫聚类和系统产生分析的步骤 ，将人类基因追忆到26个春秋集中中 ，该春秋分类战术极大提升了春秋鉴定中的正确性 。在此基础上 ，钻研团队整合分析了多组学水平上10种分歧的ARS ，蕴含基因长度、GC含量、表白量、甲基化水平、蛋白与蛋白交互网络（PPIN）等 ，通过主成分分析步骤系统解析 ，发现GC含量和PPIN是与基因春秋最为有关的两种演化印记 。同时 ，进一步钻研揭示出与多拷贝基因（Duplicates）相比 ，PPIN在单拷贝基因（Singletons）中与基因春秋的有关性更为显著 。
该钻研成就将为进一步索求人类基因形成的分子机造（尤其是De novo基因） ，挖掘与癌症有关的基因演化汗青 ，以及深刻探求疾病产生发展的机造机理钻研等奠定沉要基础 。
此工作获得了中科院战术性先导科技专项赞助、国度高技术钻研和发展打算（863打算）等赞助 。
论文链接：http://gbe.oxfordjournals.org/content/early/2016/09/07/gbe.evw216
图1 基因春秋有关的ARS主成分分析
