GA黄金甲

　　2013年第6期Genomics, Proteomics & Bioinformatics（GPB）纸质版期刊已经出版
，共颁发文章6篇
，蕴含4篇钻研性文章
，1篇快报和1篇步骤学文章。

　　预兆子痫是指孕妇在怀孕期间
，产生血压上升（怀胎型高血压）
，归并蛋白尿、水肿等景象。钻研批注
，预兆子痫女性所生女儿罹患乳腺癌的风险降低
，但机造尚不明显。Chung-Cheng Hsieh博士（美国）等选取血浆NanoUPLC-MSE蛋白质组分析步骤
，比力了预兆子痫孕妇和正常孕妇脐带血数据
，发现了蕴含甲胎蛋白在内的多种差距表白的蛋白
，这为深刻钻研预兆子痫与乳腺癌易感性的关系提供了新的思路。

　　基因组和后基因组技术的飞快发展使我们能够很容易获得大量数据信息
，但还必要生物学知识来援手我们更好地认知趣关复杂机造
，如相识植物的免疫应答机造可援手人们高效地进行作物出产经营。Liliana López-Kleine博士（哥伦比亚）等利用现有拟南芥和木薯基因组数据
，选取微阵列和RNA-seq相结合的整体分析步骤钻研了免疫有关基因与其他基因在调控网络中的互有关系
，并预测了一些新的免疫有关基因
，该步骤为免疫应答钻研提供了有利的凭据证明。

　　为了进一步说明microRNA在肝癌中的作用
，Mahmoud ElHefnawi博士（埃及）等选取新的生物信息学步骤对26种肝癌细胞的miRNA进行了指标预测和职能分析
，同时还揭示了肝癌致癌信号通路的关系
，通过综合分析批注miRNA可分类为肿瘤抑造或肿瘤促成miRNA； 因而一些miRNA可作为医治靶标
，而另一些则可作为医治剂
，miRNA的这一双沉角色也正讲了然其在细胞自动调节中的积极作用
，为microRNA在肿瘤中的作用钻研提供了可行的钻研步骤。

　　基因组学与蛋白质组学是生物医学钻研的重要技术
，Nichole Reisdorph博士（美国）等通过提供短期的实际操作培训课程
，为钻研者们提供了很好的进建和磨炼的机遇。该培训蕴含讲座、尝试室操作、视频演示、软件操作等等
，文章重要就课程细节及参与者对课程的评估进行了描述
，证明该培训对钻研者申请基金、颁发文章都是极度有益的。

　　阴路毛滴虫的翻译肇始因子eIF5A（TveIF5A）被宽泛以为有羟腐胺赖氨酸、磷酸化及糖基化建饰
，已有3个分歧的亚型（pI5.2、pI5.3和pI5.5）被报路。María Elizbeth Alvarez-Sánchez博士（墨西哥）等以为分歧TveIF5A亚型与其磷酸化建饰有关
，因而利用质谱分析法鉴定了这些亚型的磷酸化位点并证了然他们的如果。钻研同时批注内源酪蛋白激酶2可能参加了TveIF5A磷酸化建饰。

　　真核生物的蛋白质运输和分选是一个复杂的过程
，目前有很多步骤利用序列信息来预测蛋白的亚细胞定位。在以往平面或平行结构预测的基础上
，Geetha Govindan博士（印度）等介绍了一种利用集成分类器进行蛋白分选分层预测的步骤——Bagging with CTD, 经尝试验证并与现有步骤比力分析
，证明该步骤精确度高
，在获取蛋白质排泄蹊径的生物学个性钻研中可起到极度有效的作用。

　　以上文章全文可在GPB主页 或ScienceDirect数据库中浏览下载
，迎接各人阅读、引用。

　　另表
，GPB将在今年4月出版“Ribogenomics”的专刊
，由主编于军博士亲自担任Guest editor
，迎接各人积极投稿。

　　附：本期目录

　　Original Research 

　　Screening Preeclamptic Cord Plasma for Proteins Associated with Decreased Breast Cancer Susceptibility 

　　Identification of Immunity-related Genes in Arabidopsis and Cassava Using Genomic Data 

　　An Integrative Meta-analysis of MicroRNAs in Hepatocellular Carcinoma 

　　Hands-on Workshops as An Effective Means of Learning Advanced Technologies Including Genomics, Proteomics and Bioinformatics 

　　Letter 

　　Identification of the Phosphorylated Residues in TveIF5A by Mass Spectrometry 

　　Method 

　　Bagging with CTD - A Novel Signature for the Hierarchical Prediction of Secreted Protein Trafficking in Eukaryotes