GA黄金甲

　　2013年第4期Genomics,Proteomics & Bioinformatics（GPB）纸质版期刊已经出版
，共颁发文章7篇
，蕴含1篇综述
，4篇钻研性文章
，1篇利用注明和1篇会议汇报
。

　　多形性胶质母细胞瘤（Glioblastoma multiforme, GBM）是中枢神经系统最常见的原发性肿瘤
，化疗药物烷化剂替莫唑胺（alkylating agent temozolomide）常被用来医治该疾病
，但人体对替莫唑胺的天然或获得性免疫会使医治失败
。Pier Jr Morin博士（加拿大）等就GBM的形成、医治步骤、替莫唑胺耐性的分子机造、若何解决耐药性几方面进行了综述
，强调了肿瘤代谢组学在替莫唑胺耐性早期诊断中的作用
，为GBM的医治提供了新的步骤
，拥有沉要意思
。

　　烟碱型乙酰胆碱受体（nicotinic acetylcholine receptors, nAChRs）与尼古丁依赖性、感情异常、神经退行性病变及神经；ぷ饔糜泄
，但其蛋白质组学钻研还很少
。Marina R. Picciotto博士（美国）等利用转基因幼鼠模型对α4β2* nAChRs与其他蛋白质的相互作用关系进行了索求
，并选取iTRAQ步骤进行了蛋白质组学分析
。鉴定出了208种能与nAChRs免疫共沉淀的蛋白
，其中17种与α4β2 nAChRs显著有关
，这为需找新的药理学靶标提供了凭据
。

　　Roman A. Zubarev博士（瑞典）等介绍了一种新的蛋白质组学分析步骤——蛋白质组氨基酸和元素组成成分分析法（Proteome-wide Amino aCid and Elemental composition, PACE）
，经验证
，该步骤单一、活络
，可宽泛使用
，获得的数据信息量大
，有望成为蛋白质组学钻研的尺度化分析工具
。

　　在我所刘斯奇博士领导下
，杨蕾博士等利用real-time PCR和质谱多反映监测法检测5种分歧的肝细胞系中醛酮还原酶（aldo-keto reductases, AKRs）基因和蛋白表白情况
，钻研AKRs在肿瘤产生中的作用
。了局批注
，AKR1C蛋白的高表白与肝肿瘤产生亲昵有关
，HuH7细胞系中AKRs的表白与其它四种细胞系齐全分歧
。该钻研初次提供了肝细胞系中AKRs在mRNA和蛋白水平表白的全数定量信息
，为目前技术前提下选择临床生物象征物提供了新的思路
。

　　钻研蛋白质间相互作用关系对药物设计有沉要作用
。Premendu P. Mathur博士（印度）等研发了一个可用来分析蛋白质间相互作用机造的综合性数据库——PepBind（Peptide Binding Protein Database）
，蕴含3100种蛋白质复合物的结构、序列信息及一个可推算蛋白质间相互作使劲强弱的推算工具
。该数据库可在http://pepbind.bicpu.edu.in/免费使用
。

　　特异性等位基因表白与有关顺式作用元件突变和等位基因特异性表观建饰模式有很大关系
，也可能与植物中的杂种优势有关系
。本刊编委Xiangfeng Wang博士（美国）等通过追踪杂交玉米幼苗组织的特异性等位基因表白模式和表观建饰模式
，分析其转录组、组蛋白建饰和DNA甲基化的高通量测序数据
，综合卡方检验和泊疏松布等数学理论
，研发了一种新的推算框架来鉴定特异性等位基因的表白
，为有关领域的科学钻研提供了很好的推算步骤
。

　　2013年5月18、19日
，在北京召开了“数学、推算机与性命科学交叉钻延妆青年学者论坛
，会议由GA黄金甲国度数学与交叉科学中心主办
，共有21位在有关领域获得凸起成就的青年学者作学术汇报
，内容涵盖推算生物学、推算基因组学、新一代测序数据分析与利用、癌症基因组学、表观基因组学、元基因组学、蛋白质组学及系统生物学等钻研领域
。本注销格约请到会议主席王秀杰博士（中科院遗传发育所）和张世华博士（中科院数学与系统科学钻研院）为我们撰写了本次会议的会议汇报
，但愿能给各人带来启发
，对数学、推算机与性命科学交叉钻研与利用实际的迅快发展有推进作用
。

　　另表
，GPB将在明年2月出版“Ribogenomics”的专刊
，由主编于军博士担任Guest editor
，迎接各人积极投稿
。

　　以上文章全文可在GPB主页（http://www.elsevier.com/locate/gpb）或ScienceDirect数据库（www.sciencedirect.com/science/journal/16720229）中浏览下载
，迎接各人阅读、引用
。