基因组所参与国际基因组ENCODE打算获得系列钻研成就
近日,国际科学界颁发“DNA元素百科全书”(简称ENCODE)打算获得了迄今最具体的人类基因组分析数据,并以30余篇论文的大局同时颁发在Nature、Science、Genome Research、Genome Biology等一系列高水平的SCI学术期刊上。ENCODE被以为是继“人类基因组打算”之后国际科学界在性命科学钻研领域获得的又一沉猛进展。以往钻研者常关注与编码蛋白质有关的基因,但它们只占整个基因组的约2%。ENCODE钻研团队实现相识析基因组非编码区域的工作,人类基因组中约80%的区域都被确定占有某种确定的职能。ENCODE项目从近期看有利于测序产业,基因组会成为更热的钻研方向,而从长远来看,其影响深远,对疾病诊断、药物研发等都将拥有积极的推作为用,新增市场价值当以万亿美元推算。
始于2009年的基因组所方向东钻研员项目组利用与美国华盛顿大学基因组学系成立多年的合作关系,选派该组青年科技骨干渠鸿竹博士,通过屡次接见互换和客座钻研等大局,与ENCODE打算掌管人之一、美国国立卫生钻研院西北注解表观基因组画图中(Northwest Reference Epigenome Mapping Center,NIH)主任John A. Stamatoyannopoulis博士所辅导尝试室钻研人员一路工作,迄今为止已经共同颁发了三篇标志性的ENCODE文章。
在渠鸿竹博士作为共同第一作者、基因组所第二作者单元的Genome Research所颁发文章中,渠鸿竹博士重要掌管生物信息学分析工作,将沉要转录因子与染色质DNA之间的相互作用和DNA甲基化这两个分歧档次的表观基因组学数据进行统合钻研,对于CTCF在染色质DNA的结合效能和DNA甲基化之间的互有关系进行钻研并获得了创新进展。在基因组所作为第二作者单元的Science所颁发文章中,渠鸿竹博士作为生物信息学团队的重要成员,重要掌管将全基因组DNase I图谱等表观基因组数据与已有的GWAS SNPs数据结合,初次在表观基因组水平上发展GWAS钻研工作,为钻研复杂性疾病的遗传机造提供了全新的钻研战术。
在9月5日Nature在线颁发的文章中,渠鸿竹博士与Stamatoyannopoulis博士尝试室钻研人员地点尝试室的科研人员利用新一代高通量测序平台实现了125种人类细胞和组织的DNase I 高敏感微点(DHSs)的全基因组图谱,初次展示了至今为止最为详尽的人类基因组调控DNA图谱,揭示了染色质可及性、转录、DNA甲基化、序列特异性转录因子结合谱式等分歧档次的表观遗传调控成分之间复杂的互有关系。本项钻研对于彻底读懂、读通人类基因组这本“天书”拥有沉要的意思。
基因组所通过“引进来、走出去”等矫捷多样的合作造就机造,与美国芝加哥大学、美国华盛顿大学、美国西南医学中心大学、等国际顶尖钻研机构维持了亲昵的互换与合作关系,积极参加沉大科学钻研打算,实时把握世界前沿科学的发展脉络,有效提升钻研所的学术职位和国际名誉,致力造就青年科技骨干人才急剧成才。从前几年的成功经验证明:基因组地点人才行列建设方面已经进行了了有益的索求,并且获得了令人瞩主张成就,为今后的科技创新争优工作的可持续发展奠定了坚实的基础。
文章链接:
http://www.nature.com/nature/journal/v489/n7414/full/nature11232.html

图:利用DNase I和H3K4me3数据钻研未知启动子以及转录方向






