基因组所人类全基因组关联分析国际合作钻研获沉猛进展
日前，中科院北京基因组钻研所沉大疾病基因组与个别化医疗尝试室方向东钻研员，项目组助理钻研员渠鸿竹博士等发展的国际合作钻延装人类疾病全基因组关联分析钻延妆获得沉猛进展，有关钻研成就《Systematic Localization of Common Disease-Associated Variation in Regulatory DNA》于2012年9月在《Science》杂志颁发。本钻研进一步选取新一代高通量测序技术，在表观基因组水平上发展全基因组关联分析(Genome-wide association study; GWAS)钻研，并且在该钻研领域获得了新的进展。
渠鸿竹博士和华盛顿大学美国国立卫生钻研院西北注解表观基因组画图中心(Northwest Reference Epigenome Mapping Center，NIH)主任、华盛顿大学基因组学系副教授John A. Stamatoyannopoulis博士所辅导尝试室的钻研人员，通过度析人类349种细胞和组织样本的全基因组DNase I图谱与已有的GWAS SNPs数据，发现约93％的与疾病和性状有关的SNPs位于非编码序列内，并且集中在DNase I高敏感位点区域(DHSs)。88％含有SNP的DHSs存在于胎儿发育阶段，并且在这些DHSs内的SNPs与怀胎露出有关表型(gestational exposure-related phenotypes)有关。此表，与含有SNP的DHS亲昵有关的远距离靶基因(绝大无数基因距离该DHSs超过100 kb)行使的职能与统一SNP有关的疾病表型相类似，该联系拓展了在基因组水平疾病与性状之间的关联性，同时提供了一个潜在的致病基因库来诠释这种关联性。93.2%DHSs内部的疾病有关SNPs同时位于转录因子鉴别序列内，并影响终部门的染色质结构。这些转录因子进一步形成复杂的网络系统，调控与疾病有关的基因表白。此项钻研突破性地从表观基因组水平进行GWAS分析，并在系统生物学理论的领导下，通过统合的生物信息学分析战术，从而成立疾病与生物学性状之间关联性的调控网络模型，为说明人类常见疾病与基因性状之间的互有关系提供了崭新的科学视角和有利的钻研工具。
全基因组关联分析(GWAS)的重要主张是在人类全基因组领域内寻找与疾病有关的序列变异，即单核苷酸多态性(SNP)。GWAS钻研在某种疾病患者的全基因组领域内检测出SNP位点并与对照组人群进行比力，筛选所有的变异等位基因频率，预防了象候选基因战术一样必要预先如果致病基因，从而为复杂疾病的发病机造钻研提供了更多的线索。
文章链接：http://www.sciencemag.org/content/337/6099/1190
图：与血幼板数量有关的GWAS SNP与222 kb 以表的JAK2基因有关联
