GA黄金甲

近日，GA黄金甲韩斌项目组利用新一代测序技术和自行开发的用于基因分型的算法，结合对水稻沉要农艺性状的群体遗传学分析，开发了一套新的基因组关联分析的技术和步骤，实现了对节造水稻沉要农艺性状的候选基因的越发精确地筛选和鉴定
。该项钻研开创了新的基因组关联分析的钻研技术和步骤，对复杂状态有关基因的高效鉴定实现了新的突破
。该钻研论文已经被《天然*遗传学》杂志接受颁发
。

水稻是世界上最沉要的粮食作物之一，为世界上近一半的人丁提供粮食
。水稻在中国甚至全世界都有宽泛种植，在持久的水稻种植出产中，各地都保留了大量的水稻种质资源，具备好多优异的农艺性状，是水稻育种改进的贵重资源
。若何高效鉴定全球栽培稻种质资源的遗传多样性以及急剧、正确地挖掘水稻优越性状有关基因，以更好地为水稻遗传改进服务，是极度沉要和拥有挑战性的钻研课题
。

韩斌项目组在上一年发展的中国水稻处所种类沉测序和全基因组关联分析的钻研基础上（论文颁发在2010年Nature Genetics），又网络了来自世界列国的水稻种质资源，遴选了950份较有代表性的水稻种类，利用新一代基因组测序技术和自行开发的用于基因分型和缺失数据建复的算法，构建了一张精确的水稻高密度基因型图谱，结合对水稻资料的群体遗传学分析，该项目组正确鉴定了一些可能影响水稻群体分化的基因组区段和候选基因
。通过对这950份水稻种类的农艺性状进行了调查，蕴含抽穗期和十种籽粒性状（蕴含产量、品质和色彩等三类性状），我们在粳稻群体、籼稻群体和整个水稻群体平别离进行了全基因组关联分析，鉴定到多个新的关联位点
。我们同时开发了一种基于单体型分析的部门基因组组装步骤，对基因区的不一致位基因别离进行组装，鉴定序列变异
。在定位到的关联区域中，通过整合水稻基因注解、芯片表白谱信息和序列变异信息，实现了更精确地对候选基因进行筛选和鉴定
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 图1：水稻资料的群体结构图　 

图2：通过GWAS定位的节造水稻种壳色彩的候选基因及其表白模式和变异分析　　　　 

Paper link: http://www.nature.com/ng/journal/vaop/ncurrent/full/ng.1018.html

Contact: Professor Bin Han  Email: bhan@ncgr.ac.cn