基因组所实现“猪源性H1N1型流感病毒”A/Swine/Hubei/01/2007”全基因组分析测序和分析工作
基因组所继5月4日实现由武汉病毒钻研所提供“猪流感H1N1型病毒A/Swine/Hubei/01/2007”部门基因测定和分析工作后,于5月10日已根基实现此样本的全基因组测序和数据分析。
目前,所获得序列已占该病毒株全基因组序列的94.73%,全基因序列的覆盖度则达到了98.34%。经与其他起源的猪流感病毒进行对比,发现与1986年分离的一株H1N1亚型人流感病毒(A/Singapore/6/1986),以及2006年分离的一株H1N1亚型猪流感病毒(A/swine/Henan/01/06)类似度最高,可能为其起源。而与2009年最新流感病毒的类似性比力,差距较为显著(77%-88%),批注两个病毒应为分歧起源。
同时,通过进化分析,发现这次盛行的最新流感病毒不是忽然出现的,而是一向就在世界各地的猪身上传布繁衍,且与在人类传布的H1N1病毒有较大的差距,其占有的禽流感病毒的特点也许是最近发作并迅快舒展的原因。而我国猪H1N1亚型流感病毒则与之分属分歧的进化分支,其同源性不高,不是本次发作的流感的病毒,危险性相对较低。
目前,基因组地点不休的补充和美满数据,为我国防治疫情做好科研基础工作。
北京基因组钻研所
2009年5月12日
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