中华绒螯蟹血液表白谱分析文章颁发
2009年2月,中科院北京基因组钻研所基因组科学及信息沉点尝试室与华东师范大学性命科学学院合作的钻研成就,“Discovery of immune-related genes in Chinese mitten crab (Eriocheir sinensis) by expressed sequence tag analysis of haemocytes” 论文在《Aquaculture》杂志上颁发。
甲壳动物养殖在全世界水产养殖业中占有极其沉要的职位,2004年,在世界水产品出产总值中,甲壳动物总沉量虽仅占6.19 %(约3.68 百万吨),但总价值中却占到了20.4 %(约1.44 百亿美元)。中华绒螯蟹俗称河蟹,是中国驰名的淡水蟹,拥有沉要的经济价值,从80年代以来河蟹养殖业发展迅快,已成为水产养殖支柱产业之一。陪伴着养殖业的迅猛发展,甲壳动物的病害也呈上升趋向,在河蟹多多病害中,战抖病是最为常见、风险最为严沉的一种。此暴发性疾病往往造成严沉的经济损失,殒命率达70%以上。它的病害防治,至今仍是水产界面对的难题之一。甲壳动物不足特异性的免疫系统,它们的免疫防御重要由细胞和体液免疫系统所组成,通过血细胞或淋巴细胞的吞噬、包囊作用排除异己的微生物和病原体?咕(antimicrobial peptide,AMP)作为其中一种免疫因子在生物中宽泛存在,它是在表界前提刺激下,生物免疫防御系统产生的一类匹敌表源性病原体致病作用的拥有免疫活性的多肽物质,是脊椎动物、无脊椎动物和植物先性子免疫的关键因子。而在淡水种类如中华绒螯蟹中还未见有关报路。为了充分鉴定河蟹的免疫有关的基因,发现潜在的抗菌肽,提高蟹体自身免疫能力,我们与华东师范大学合作,以其血液为资料,利用EST分析的伎俩对其转录组进行了钻研。
科研人员对样品随机测序(5’端)3118条,一共得到3041条高质量的EST序列,并最终得到1039条unigene(319条contig和720条singleton)。通过与公共数据库内的序列进行比对,总共注解了488(47%)个基因。通过基因表白丰度和职能分析(重要是GO和KAAS),对其基因表白谱特点有了全面的意识。其中与免疫有关的基因共鉴定到26个基因,凭据其职能重要分为五类——抗菌肽、酚氧化酶系统、超氧化物歧化酶系统、凝固系统和模式鉴别分子。重要的免疫因子为Kazal-type proteinase inhibitor和the C-type lectin,我们还鉴定到三种潜在的抗菌肽分子,为之后克隆其全长基因序列并钻研职能奠定了基础。
有关了局在,《Aquaculture》上颁发
Aquaculture 2009; 287: 3-4 P297-303
Published online 2009 February 18. doi:10.1016/j.aquaculture.2008.10.050.
Zhao D, Song S, Wang Q, Zhang X, Hu S, Chen L.
Discovery of immune-related genes in Chinese mitten crab (Eriocheir sinensis) by expressed sequence tag analysis of haemocytes
全文链接:
http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6T4D-4TVJ3J0-2&_user=5564623&_rdoc=1&_fmt=&_orig=search&_sort=d&view=c&_acct=C000067722&_version=1&_urlVersion=0&_userid=5564623&md5=533692b0df6cb9bf9be8cf2b629d9c03






